通常情况下，打完HPV疫苗后发现自身存在HPV病毒感染的情况是正常的。患者不必过于担心，在医生指导下进行针对性治疗即可。

HPV是一种人乳头瘤病毒，主要通过性生活传播，如果在接种前已经感染了该病毒，则可能会导致机体出现局部红肿疼痛等症状。此时再注射HPV疫苗可能无法起到预防的作用，并且还有可能导致病情加重的现象发生。因此建议患者及时到正规医院就医，可以在医生指导下使用阿昔洛韦软膏、咪喹莫特霜等药物涂抹患处缓解不适的症状。必要时也可以遵医嘱服用抗病毒类药物辅助改善，比如利巴韦林颗粒、盐酸伐昔洛韦片等。

另外，在日常生活中要注意个人卫生，勤换内裤，避免不洁的性行为。同时还要注意饮食健康，多吃一些新鲜的水果和蔬菜以及富含优质蛋白的食物，能够补充身体所需要的营养物质，增强自身的免疫力。若期间出现明显不适或异常情况，请尽早就诊检查明确诊断并积极接受治疗。